官子萱作为海洋生物研究学家，在一次对短头鲵研究的过程中，短头鲵发生变异并逃走。而在此之前，官子萱的父亲因为调研大鲵也消失了，官子萱为了找到这个变异大鲵找到父亲，决定启程深海，前往荒岛。

　　在民国时期，中国大陆正经历着军阀割据和混战的困局。日本在东北扶植伪满州政权，暗中策划侵华计划。与此同时，远东古玩黑市上出现了大量来自关外的珍贵文物。为了保护这些国宝，中央文物保护组织决定启动一项重要行动。他们在远东铁路枢纽哈尔滨秘密开设了一条专线铁路，旨在将关外收集到的国宝安全运送到关内。然而，九龙镇一带的满清秘藏成为了盗墓贼们争夺的目标，频繁的炸山事件引起了广泛关注。这一切表明，国宝专线的安全已经受到威胁，特别是日本军方对这条专线的察觉，使得保护工作变得愈发紧迫。
　　在这样的背景下，年轻的考古学家张一鸣和杜萧接到了文物保护组织的紧急任务。他们被要求在十天内完成一项艰巨的任务——将满清秘藏中的珍贵国宝送上即将取消的最后一班列车。他们两人虽然都是文弱书生，但都怀着一腔爱国热忱和丰富的考古知识。他们迅速前往九龙镇，面对着层层艰难的挑战，开始了紧张而充满危险的国宝守护之旅。他们必须充分利用自己的专业知识，克服重重困难，以确保这些珍贵的文物能够安全送达。

　　幼时的土行孙在一次探险中亲眼目睹父亲的死亡，胆怯的他再也不使用异能。在蔡叔收养下长大的土行孙喜欢上了古奇店老板的女儿归蝶。与此同时统治者为求长生，令方士寻其道。方士确认了土行孙身上他父亲的遗物就是自己要找的徽章，便以归蝶作要挟，迫使土行孙带领众人寻找遗迹入口，危险一触即发。